巴彥淖爾市環(huán)境科學研究所是巴彥淖爾市環(huán)境保護局直屬單位，負責全市經濟發(fā)展重大戰(zhàn)略中環(huán)保方針、政策及相關法規(guī)體系方面的研究和環(huán)境、經濟、社會可持續(xù)發(fā)展、環(huán)境決策支持技術研究;承擔地方環(huán)境標準的研究、地區(qū)環(huán)境容量方法的研究;組織重大環(huán)境科研項目、應用技術研究;負責開展突出環(huán)境問題與生態(tài)問題的研究;組織全市環(huán)境規(guī)劃方法、研究和負責全市環(huán)境綜合整治規(guī)劃、計劃的編制工作;負責開展‘三廢’綜合利用技術，生態(tài)工程建設的研究等工作，負責全市建設項目環(huán)境影響評價工作。